ビジュアル化のツールを幾つか紹介していきます。数値だけではわからないことも図にしてみると関係性等が明らかになってきます。
1つ目は「Cytoscape」。インストール方法はこちら → Cytoscape
私もまだ使いこなしていませんが、モノとモノなどのネットワークを俯瞰することができます。 タンパク質の関係、シグナルの伝達あるいは論文の引用状態、人間関係なども可視化できます。
Cytoscapeの応用例が書かれた資料をご覧ください。 → http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS62_Cytoscape.pdf&refer=AJACS62
以前紹介した統計ソフト「R」やpythonとのデータのやり取りも可能なようです。
起動したら、右の方にデモのファイルがあります。開けて見てください。 ネットワークをビジュアル化して表現するのに使えそうです。