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ネットワークをビジュアル化

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ビジュアル化ツールを幾つか紹介していきます。数値だけではわからないこともにしてみると関係性等が明らかになってきます。

1つ目は「Cytoscape」。インストール方法はこちら → Cytoscape

私もまだ使いこなしていませんが、モノモノなどのネットワークを俯瞰することができます。 タンパク質の関係、シグナルの伝達あるいは論文の引用状態人間関係なども可視化できます。

Cytoscapeの応用例が書かれた資料をご覧ください。 → http://motdb.dbcls.jp/?plugin=attach&pcmd=open&file=AJACS62_Cytoscape.pdf&refer=AJACS62

以前紹介した統計ソフト「R」やpythonとのデータのやり取りも可能なようです。

起動したら、右の方にデモのファイルがあります。開けて見てください。 ネットワークビジュアル化して表現するのに使えそうです。

 

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